Ihmisen Proteome Project (HPP) käynnistettiin vuonna 2010 onnistuneen päätökseen saattamisen jälkeen Ihmisen Genome Project (HGP) tunnistaa, karakterisoida ja kartoittaa ihmisen proteomi (koko joukko proteiineja, joita ilmaisee ihmisen perimä). HPP on julkaissut 90.4-vuotispäivänä ensimmäisen erittäin vaativan suunnitelman, joka kattaa XNUMX % ihmisen proteomi. Elämän koodina tällä virstanpylväällä on erittäin merkittäviä vaikutuksia ihmisen terveyteen ja terapiaan.
Valmis 2003: ssä, Ihmisen Genome Project (HGP) oli vuonna 1990 perustettu kansainvälinen yhteistyö, jonka tavoitteena oli tunnistaa koko joukko ihmisen geenejä ja määrittää DNA-emästen täydellinen sekvenssi ihmisen perimä. 15. tammikuuta 2001 HGP oli julkaissut alkuperäisen sekvenssin ja analyysin ihmisen perimä. Tunnistaminen, karakterisointi ja kartoitus ihmisen proteomi (koko genomin koodaama proteiinikomplementti) oli seuraava looginen askel. Siksi, Ihmisen Proteome Organization (HUPO) perustettiin 9. helmikuuta 2001 edistämään proteomiikan tutkimusta. 23 HUPO käynnistettiin virallisesti Ihmisen Proteome Project (HPP), jonka tavoitteena on valmistella suunnitelma ihmisen proteomia (1).
- ihmisen genomin ennustaa noin 20,300 XNUMX proteiinia koodaavaa geeniä. Koko näiden geenien koodaama proteiinisarja muodostaaihmisen proteomi'. Ihmisen proteomi on paljon suurempi kuin "ihmisen genomi", koska yksi geeni voi ilmentyä eri muodoissa (proteoformeissa) translaation aikana ja sen jälkeen tapahtuvien kemiallisten modifikaatioiden seurauksena. On arvioitu, että miljoona proteoformia voi esiintyä rinnakkain yhdessä yksilössä. Vuonna 2010 HPP:n alkaessa tunnistettiin tuskin 70 % genomianalyysin ennustamista proteiineista. Proteome-projektin tavoitteena oli täyttää tämä tietovaje. Tekniikan kehityksen myötä proteiineja ja niiden muotoja voidaan havaita ja kvantifioida entistä tarkemmin. Siitä huolimatta puuttuu hyvä määrä proteiineja (proteiinit genomianalyysin ennustama, mutta vielä havaitsematon) (2,3). Projekti on vielä kesken; virstanpylväs on kuitenkin saavutettu.
HPP julkaisi 16. lokakuuta 2020 kymmenenvuotispäivänään ensimmäisen erittäin vaativan suunnitelman, joka kattaa 90.4 % ihmisen proteomista. (1). Tämä parantaa huomattavasti tietämystämme ihmisen biologiasta ja ymmärrystämme molekyylimekanismeista solu- ja molekyylitasolla, erityisesti ihmisen proteomin roolista, joka johtaa suoraan syöpien, sydän- ja verisuonitautien sekä tartuntatautien diagnostiikan ja terapeuttisten menetelmien tutkimukseen ja kehittämiseen erityisesti yksilöllisiin ja tarkkuuslääketiede (4).
Ihmisen kehitys Proteiini Atlas on erittäin merkittävä edistysaskel lisätutkimuksessa ihmisen diagnostiikan ja terapian alalla (5,6).
***
Viitteet:
- HUPO 2021. Proteomics aikajana. Saatavilla https://hupo.org/Proteomics-Timeline.
- neXtProt 2021. Ihmisen proteomi. Saatavilla verkossa osoitteessa https://www.nextprot.org/about/human-proteome Käytetty 30.
- Inserm, 2020. Proteomiikka: elämän koodi, joka on käännetty yli 90 %:lla. Julkaistu 07. joulukuuta 2020. Saatavilla verkossa osoitteessa https://www.inserm.fr/actualites-et-evenements/actualites/proteomique-code-vie-traduit-plus-90 Käytetty 30.
- Adhikari, S., Nice, EC, Deutsch, EW et ai. 2020. Erittäin tiukka suunnitelma ihmisen proteomista. Julkaistu: 16. lokakuuta 2020. Nature Communication 11, 5301 (2020). DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-020-19045-9
- Digre A. ja Lindskog C., 2020. The Human Protein Atlas – Ihmisen proteomin spatiaalinen lokalisointi terveydessä ja sairaudessa. Protein Science Volume 30, Issue 1. Ensimmäinen julkaisu: 04. marraskuuta 2020. DOI: https://doi.org/10.1002/pro.3987
- The Human Protein Atlas 2020. Human Protein Atlas Saatavilla verkossa osoitteessa https://www.proteinatlas.org/about Käytetty 30.
***
