SARS-CoV-2: Kuinka vakava on B.1.1.529-variantti, nyt nimeltään Omicron

B.1.1.529-variantti ilmoitettiin ensimmäisen kerran WHO:lle Etelä-Afrikasta 24^th marraskuuta 2021. Ensimmäinen tunnettu vahvistettu B.1.1.529-infektio oli näytteestä, joka kerättiin 9.^th marraskuu 2021¹. Toinen lähde² osoittaa, että tämä variantti havaittiin ensimmäisen kerran näytteissä, jotka kerättiin 11^th marraskuuta 2021 Botswanassa ja 14^th marraskuuta 2021 Etelä-Afrikassa. Sen jälkeen COVID-19-tapausten määrä on kasvanut jyrkästi lähes kaikissa Etelä-Afrikan provinsseissa. Kuten 27^th Marraskuussa 2021 uusia tämän muunnelman tapauksia on raportoitu myös Belgiassa, Hongkongissa, Israelissa ja Yhdistyneessä kuningaskunnassa³, Saksassa, Italiassa ja Tšekin tasavallassa, jotka kaikki liittyvät lähtökohtaisesti matkailuun.  

Kiitos Etelä-Afrikan viranomaisille siitä, että he eivät käyttäneet aikaa kommunikoidakseen ja jakaakseen asiaankuuluvaa tietoa maailmanlaajuisen tiedeyhteisön kanssa, jotta WHO:n asiantuntijaryhmä voisi kokoontua 26.^th marraskuuta 2021 ja nimeä tämä versio nopeasti huolenaiheeksi (VOC). Asian vakavuus voitiin arvioida siitä, että B.1.1.529 nimettiin seurannassa olevaksi variantiksi (VUM) vasta kaksi päivää sitten 24.^th marraskuuta 2021 ennen kuin se nimettiin VOC:ksi 26^th marraskuuta 2021 ilman, että sitä on nimetty ensimmäisenä tutkimuksen kohteena olevaksi versioksi (VOI).  

Taulukko: SARS-CoV-2:n huolta aiheuttavat variantit (VOC) 26. marraskuuta 2021 

B.1.1.529:n nimeäminen huolenaiheeksi (VOC) oli perusteltua, koska havaittiin, että tämä variantti on SARS-CoV-2:n toistaiseksi eniten poikkeava variantti. Verrattuna alun perin Kiinan Wuhanissa havaittuun SARS-CoV-2-virukseen, tässä on jopa 30 aminohappomuutosta, 3 pientä deleetiota ja 1 pieni insertio piikkiproteiinissa. Näistä muutoksista 15 sijaitsee reseptoria sitovassa domeenissa (RBD), joka on viruksen osa, joka mahdollistaa sen pääsyn ihmissoluihin, mikä johtaa infektioon. Tässä variantissa on myös useita muutoksia ja deleetioita muilla genomialueilla². Mutaatiot ovat niin laajoja, että sitä voisi kutsua uudeksi kannaksi variantin sijaan. Uskomattoman suuri määrä piikkimutaatioita tarkoittaa lisääntynyttä mahdollisuutta paeta tunnetuista vasta-aineista, mikä tekee tästä variantista vakavan huolen⁵.  

Vaihtaminen uusiin muunnelmiin on yleistä koronaviruksille. Koronaviruksille on aina ollut luonteenomaista, että niiden genomissa tapahtuu mutaatioita erittäin nopeasti, koska niiden polymeraasien nukleaasiaktiivisuus ei ole oikeita; Mitä enemmän välitystä, sitä enemmän replikaatiovirheitä ja siten enemmän mutaatioita kerääntyy genomiin, mikä johtaa uusiin variantteihin. Ihmisen koronavirukset ovat viime aikoina rakentaneet mutaatioita luodakseen uusia variantteja. Epidemioista on ollut useita muunnelmia vuodesta 1966 lähtien, jolloin ensimmäinen episodi tallennettiin⁶. Mutta miksi niin laaja mutaatio yhdessä purskeessa? Saattaa johtua siitä, että B.1.1.529-variantti kehittyi immuunipuutteisen henkilön, mahdollisesti hoitamattoman HIV/AIDS-potilaan kroonisen infektion aikana⁷.  

Mikä tahansa onkaan laajojen mutaatioiden syy, jos sen nopea leviämisnopeus Etelä-Afrikassa on osoitus, tämän muunnelman evoluutiolla voi olla valtava vaikutus nykyisin käytössä olevien rokotteiden immuniteettiin, tarttuvuuteen ja virulenssiin ja tehokkuuteen.  

Tällä hetkellä on vain vähän tietoa siitä, ovatko olemassa olevat rokotteet tehokkaita tätä uutta varianttia vastaan ​​vai tuleeko rokotteen läpimurtoinfektioita enemmän. Äskettäisessä tutkimuksessa synteettinen variantti, jossa oli 20 mutaatiota piikkiproteiinissa, oli kuitenkin osoittanut lähes täydellisen paeta vasta-aineista.⁷. Tämä osoittaa, että uusi variantti B.1.1.529, jossa on paljon lisääntyneitä mutaatioita, voi osoittaa merkittävästi vähentynyttä vasta-aineiden neutralointia. Uusi variantti näyttää kuitenkin olevan tarttuvampi, koska se on korvannut Delta-variantin Etelä-Afrikassa, vaikka nykyiset tiedot eivät ole riittävät luotettavan arvion tekemiseen. Samoin oireiden vakavuutta ei tässä vaiheessa voida kommentoida.  

Ottaen huomioon, että Euroopassa on jo viime viikkojen aikana epätavallisen suuri määrä COVID 19 -tapauksia (johtuen erittäin tarttuvasta deltavariantista) ja se on Omicron (B.1.1.529) -variantti on levinnyt Etelä-Afrikassa äskettäin korvaamassa deltavariantin, useat Euroopan maat, mukaan lukien Iso-Britannia, Saksa ja Italia, ovat asettaneet matkustusrajoituksia saapuville Etelä-Afrikasta ja naapurimaista, kuten Botswanasta, Malawista, Mosambikista, Sambiasta ja Angola. Pahinta peläten Israel aikoo kieltää vierailijoiden pääsyn kaikista maista.  

Maailma on investoinut niin paljon COVID-19-rokotteiden kehittämiseen ja antamiseen suojellakseen ihmisiä pandemialta. Tiedemiesten ja viranomaisten päällimmäisenä mielessä oleva kysymys on, ovatko tärkeimmät COVID-19-rokotteet, kuten Pfizer–BioNTech, Oxford–AstraZeneca, Moderna, Johnson & Johnson, tehokkaita myös Omicronin (B.1.1.529) varianttia vastaan . Tätä ruokkii se, että Etelä-Afrikassa on raportoitu läpimurtotartuntoja. Myös kaksi Hongkongin tapausta oli saanut rokoteannokset⁹. 

Pan-koronavirusrokotteiden kehittäminen¹⁰ (monivalenssit rokotealustat¹¹) näyttävät olevan tunnin tarve. Mutta nopeammin, voi olla mahdollista valmistaa nopeasti tehosteannoksia mRNA- ja DNA-rokotteita, jotka kattavat mutaatiot. Lisäksi äskettäin hyväksytty viruslääkkeet (Merckin Molnupiravir ja Pfizerin Paxlovid) pitäisi olla hyödyllisiä suojelemaan ihmisiä sairaalahoidolta ja kuolemalta.   

 *** 

Viitteet:  

1. WHO 2021. Uutiset – Omicronin luokitus (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern. Julkaistu 26. marraskuuta 2021. Saatavilla verkossa osoitteessa https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern  

2. Euroopan tautien ehkäisy- ja valvontakeskus. SARSCoV-2:n syntymisen ja leviämisen vaikutukset B.1.1. 529-variantti (Omicron), EU/ETA. 26. marraskuuta 2021. ECDC: Tukholma; 2021. Saatavilla verkossa osoitteessa https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529  

3. UK Govt 2021. Lehdistötiedote – Ensimmäiset Omicron-variantin tapaukset Isossa-Britanniassa tunnistettu. Julkaistu 27. marraskuuta 2021. Saatavilla osoitteessa https://www.gov.uk/government/news/first-uk-cases-of-omicron-variant-identified   

4. WHO, 2021. SARS-CoV-2-varianttien seuranta. Saatavilla verkossa osoitteessa https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 

5. GitHub, 2021. Thomas Peacock: B.1.1-jälkeläinen, joka liittyy Etelä-Afrikkaan ja jolla on suuri määrä Spike-mutaatioita #343. Saatavilla verkossa osoitteessa https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/343 

6. Prasad U.2021. Koronaviruksen muunnelmat: mitä tiedämme toistaiseksi. Tieteellinen eurooppalainen. Julkaistu 12. heinäkuuta 2021. Saatavilla verkossa osoitteessa http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/variants-of-coronavirus-what-we-know-so-far/ 

7. GAVI 2021. Rokotetyö – Mitä tiedämme uudesta B.1.1.529-koronaviruksen variantista ja pitäisikö meidän olla huolissaan? Saatavilla https://www.gavi.org/vaccineswork/what-we-know-about-new-b11529-coronavirus-variant-so-far 

8. Schmidt, F., Weisblum, Y., Rutkowska, M. et ai. Korkea geneettinen este SARS-CoV-2-polyklonaalista neutraloivaa vasta-ainetta vastaan. Luonto (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 

9. Voimakkaasti mutatoitunut koronaviruksen variantti saa tutkijat hereille. Luonto Noi. Päivitetty 27. marraskuuta 2021. DOI: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w  

10. Soni R. 2021. "Pan-coronavirus" rokotteet: RNA-polymeraasi nousee rokotteen kohteeksi. Tieteellinen eurooppalainen. Julkaistu 16. marraskuuta 2021. Saatavilla osoitteessa http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/pan-coronavirus-vaccines-rna-polymerase-emerges-as-a-vaccine-target/  

11. NIH 2021. Lehdistötiedote – NIAID myöntää uusia palkintoja "pan-koronavirus"-rokotteiden rahoittamiseksi. Julkaistu 28. syyskuuta 2021. Saatavilla osoitteessa https://www.nih.gov/news-events/news-releases/niaid-issues-new-awards-fund-pan-coronavirus-vaccines  

***